MySQL Workbench è un tool per amministrare database MySQL con l'ausilio di un ambiente di lavoro amichevole. Si rivolge a professionisti ed utenti avanzati i quali debbano progettare e gestire archivi SQL dotati di una certa complessità in termini di struttura dati. L'interfaccia è organizzata in modo funzionale per favorire la produttività degli utilizzatori. Le persone più esperte possono contare su numerosi comandi ed opzioni di configurazione per soddisfare ogni genere di richiesta.
MySQL Workbench consente di navigare fra tabelle, record e strutture dati in genere. Lo spazio di lavoro è suddiviso in tre aree principali: la prima è dedicata al puro sviluppo SQL, la seconda alla modellazione dati e la terza all'amministrazione del server. Oltre alla progettazione di nuovo archivi, sono collegabili database esistenti per editare tabelle, lanciare query, modificare script e gestire oggetti. Il supporto visivo costituisce la caratteristica di maggiore rilievo dell'applicazione, grazie anche alla possibilità di creare diagrammi entità-relazioni finalizzati alla modellazione dei database.