Jetpack Fighter è un titolo d'azione ambientato in un generico prossimo futuro in cui vi vedrete ad impersonare un giovane ragazzo che dovrà lottare per salvare la sua ragazza da un'orda di robot, mandati da un malvagio scienziato per prendere il controllo della città.
La particolarità del vostro eroe sarà quella di avere a disposizione un jetpack, grazie al quale potrà spostarsi volando e compiendo degli scatti nella direzione che impartirete voi, potrà danneggiare e distruggere i robot che si ritroverà ad affrontare in ogni livello; alla fine di ogni livello otterrete un resoconto con il punteggio ottenuto, il quale sarà basato sul fatto che abbiate completato il livello, su quanti nemici avrete eliminato e quanto tempo avrete impiegato per finirlo, dandovi un bonus in monete in base al punteggio ottenuto.
Sebbene i primi livelli di Jetpack Fighter siano perlopiù dei tutorial, in breve vi ritroverete ad affrontarne di nuovi senza nessun tipo di suggerimento o aiuto, mettendovi alla prova con nuovi tipi di minacce, quali robot più potenti, torrette laser o muri indistruttibili; l'eliminazione dei nemici vi sarà utile non solo per ottenere esperienza e punti, ma anche per ottenere nuovi pezzi di equipaggiamento, componenti grezzi e monete, quest'ultime fondamentali per poter combinare i componenti grezzi con le armi, le armature e gli equipaggiamenti in vostro possesso, così da crearne di nuovi e più potenti fino ad ottenere persino degli oggetti dalle capacità uniche.