PDF Explorer è un software dedicato alla organizzazione e gestione di documenti PDF e CHM in modo semplice e immediato. Si presta in particolare per consentire la creazione di archivi di file utilizzando un ampio set di metadati, quali nomi, dimensioni, date, titoli, soggetti, autori, pagine e sino a 100 campi per inserire dati personalizzati. La creazione degli indici di intere collezioni di documenti avviene velocemente, potendo acquisire i dati sia da dischi locali che via rete e gestire anche archivi compressi come RAR e ZIP.
PDF Explorer fornisce funzioni di ricerca avanzata di file mediante il supporto di espressioni booleane e di stringhe complete, lasciando visualizzare facilmente i risultati anche attraverso l'estrazione di immagini e testo. Gli utenti più esperti possono inoltre ricorrere a comandi batch per rendere automatica l'elaborazione di grandi insiemi di documenti. Le funzionalità del programma vengono completate dalla disponibilità di un web server per accedere alle sue opzioni tramite un semplice browser e dalla possibilità di applicare watermark per proteggere testi ed immagini.